Bir Balıkçı Gemisinin su altı alanları, operasyon sırasında ciddi kirlenme sorunlarına maruz kalır. İşletme maliyetlerini kontrol etmek ve yakıt tüketimini azaltmak için, etkili bir kirlenme kontrolüne sahip  boya kaplam sistemi uygulanarak deniz organizmalarından arındırılmalıdır. Geminin Bordası, Yaşam Mahali ve Güverte alanları sürekli deniz serpintisinin sert etkisine ve güneşten gelen UV ışınlarına maruz kalır. Bu faktörler korozyonu, aşınmayı ve renk solmasını hızlandırabilir. Bir Balıkçı Gemisinin bakımsız bir çalışma güvertesi mürettebat için aynı zamanda potansiyel güvenlik sorunları teşkil eder.